Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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UBXN8O00124 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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UBXN8O00124 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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UBXN8O00124 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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UBXN8O00124 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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