Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HRC-201ENST00000252825 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RANBP17-219ENST00000523189 4588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL590644.1-201ENST00000412427 4676 ntTSL 4 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB37-202ENST00000392610 2858 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GDPD5-209ENST00000529721 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DHX34-201ENST00000328771 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DCDC2-202ENST00000378454 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NTNG1-206ENST00000370071 3149 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02188-202ENST00000569740 3775 ntTSL 4 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC015819.3-201ENST00000624305 2674 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC134407.3-201ENST00000624035 2139 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
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