Protein–RNA interactions for Protein: C9JVI0

USP17L11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L11C9JVI0 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP17L11C9JVI0 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms