Protein–RNA interactions for Protein: A4GXA9

EME2, Probable crossover junction endonuclease EME2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME2A4GXA9 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EME2A4GXA9 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms