Protein–RNA interactions for Protein: A4D1N5

Putative uncharacterized protein FLJ40288, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4D1N5 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
A4D1N5 RFX5-215ENST00000452671 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
A4D1N5 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
A4D1N5 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
A4D1N5 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
A4D1N5 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
A4D1N5 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
A4D1N5 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
A4D1N5 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
A4D1N5 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
A4D1N5 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
A4D1N5 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
A4D1N5 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
A4D1N5 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
A4D1N5 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
A4D1N5 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
A4D1N5 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
A4D1N5 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
A4D1N5 ATG16L1-202ENST00000373525 2767 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
A4D1N5 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
A4D1N5 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
A4D1N5 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
A4D1N5 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
A4D1N5 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
A4D1N5 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
A4D1N5 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
A4D1N5 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
A4D1N5 GDPD5-202ENST00000443276 3106 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
A4D1N5 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
A4D1N5 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
A4D1N5 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
A4D1N5 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
A4D1N5 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
A4D1N5 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
A4D1N5 ANAPC7-201ENST00000450008 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
A4D1N5 POU2F2-216ENST00000560558 3282 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
A4D1N5 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
A4D1N5 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
A4D1N5 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
A4D1N5 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
A4D1N5 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
A4D1N5 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
A4D1N5 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
A4D1N5 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
A4D1N5 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
A4D1N5 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
A4D1N5 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
A4D1N5 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
A4D1N5 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
A4D1N5 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
A4D1N5 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
A4D1N5 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
A4D1N5 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
A4D1N5 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
A4D1N5 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
A4D1N5 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
A4D1N5 CLCNKB-202ENST00000375679 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
A4D1N5 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
A4D1N5 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
A4D1N5 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
A4D1N5 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
A4D1N5 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
A4D1N5 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
A4D1N5 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
A4D1N5 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
A4D1N5 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
A4D1N5 RANBP17-219ENST00000523189 4588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
A4D1N5 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
A4D1N5 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
A4D1N5 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
A4D1N5 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
A4D1N5 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
A4D1N5 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
A4D1N5 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
A4D1N5 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
A4D1N5 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
A4D1N5 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
A4D1N5 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
A4D1N5 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
A4D1N5 DCUN1D3-202ENST00000563934 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
A4D1N5 SLC4A5-202ENST00000358683 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
A4D1N5 ABLIM3-211ENST00000517451 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
A4D1N5 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
A4D1N5 LINC00477-201ENST00000483544 1710 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
A4D1N5 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
A4D1N5 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
A4D1N5 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
A4D1N5 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
A4D1N5 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
A4D1N5 Z97192.3-201ENST00000420902 2975 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
A4D1N5 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
A4D1N5 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
A4D1N5 GRID2-201ENST00000282020 6117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
A4D1N5 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
A4D1N5 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
A4D1N5 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
A4D1N5 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
A4D1N5 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
A4D1N5 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
A4D1N5 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms