Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 DOT1L-201ENST00000398665 7436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 AC090114.2-201ENST00000608477 7054 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 TRPM2-201ENST00000300481 5627 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 SOGA3-207ENST00000481848 11464 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 PRR26-201ENST00000381489 7250 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 AL357143.1-202ENST00000640531 5777 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 PIK3CG-205ENST00000496166 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms