Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 HOXC-AS3-203ENST00000514702 368 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 AC007298.2-201ENST00000551849 862 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 AKR1B1-201ENST00000285930 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 SUCLA2-205ENST00000470760 1445 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 DHDDS-217ENST00000526219 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 C5orf63-203ENST00000509733 553 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 AC011489.1-201ENST00000586744 690 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 PRMT1P1-201ENST00000604252 1009 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAP3K4Q9Y6R4 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms