Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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