Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms