Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms