Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFMBT1Q9UHJ3 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFMBT1Q9UHJ3 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms