Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
IGSF9Q9P2J2 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGSF9Q9P2J2 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGSF9Q9P2J2 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGSF9Q9P2J2 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGSF9Q9P2J2 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGSF9Q9P2J2 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGSF9Q9P2J2 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGSF9Q9P2J2 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGSF9Q9P2J2 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGSF9Q9P2J2 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGSF9Q9P2J2 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGSF9Q9P2J2 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGSF9Q9P2J2 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGSF9Q9P2J2 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGSF9Q9P2J2 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
IGSF9Q9P2J2 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGSF9Q9P2J2 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGSF9Q9P2J2 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGSF9Q9P2J2 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGSF9Q9P2J2 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
IGSF9Q9P2J2 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGSF9Q9P2J2 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGSF9Q9P2J2 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGSF9Q9P2J2 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGSF9Q9P2J2 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGSF9Q9P2J2 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGSF9Q9P2J2 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGSF9Q9P2J2 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGSF9Q9P2J2 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGSF9Q9P2J2 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
IGSF9Q9P2J2 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGSF9Q9P2J2 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGSF9Q9P2J2 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGSF9Q9P2J2 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGSF9Q9P2J2 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGSF9Q9P2J2 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGSF9Q9P2J2 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGSF9Q9P2J2 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGSF9Q9P2J2 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGSF9Q9P2J2 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGSF9Q9P2J2 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGSF9Q9P2J2 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGSF9Q9P2J2 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGSF9Q9P2J2 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGSF9Q9P2J2 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGSF9Q9P2J2 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGSF9Q9P2J2 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGSF9Q9P2J2 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGSF9Q9P2J2 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGSF9Q9P2J2 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGSF9Q9P2J2 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGSF9Q9P2J2 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGSF9Q9P2J2 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGSF9Q9P2J2 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGSF9Q9P2J2 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGSF9Q9P2J2 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGSF9Q9P2J2 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGSF9Q9P2J2 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGSF9Q9P2J2 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
IGSF9Q9P2J2 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGSF9Q9P2J2 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGSF9Q9P2J2 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGSF9Q9P2J2 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms