Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms