Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP55

BPIFA1, BPI fold-containing family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA1Q9NP55 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BPIFA1Q9NP55 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BPIFA1Q9NP55 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms