Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D5

NXF3, Nuclear RNA export factor 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF3Q9H4D5 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NXF3Q9H4D5 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms