Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms