Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 NAA60-214ENST00000572584 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 DPYSL5-207ENST00000614712 5128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC11□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 TBX3-201ENST00000257566 4208 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC11□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 PRPF38A-201ENST00000257181 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 EBF2-203ENST00000520164 5145 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 PHF20-203ENST00000374012 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF398-201ENST00000426851 5268 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC11□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC11□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC11□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 ADARB1-214ENST00000629643 4583 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGEF33-201ENST00000398800 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC6A19-201ENST00000304460 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 NAV1-203ENST00000367302 9685 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 TRUB2-201ENST00000372890 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 MCFD2-212ENST00000444761 4169 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 WDR47-204ENST00000369965 4240 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM104-204ENST00000582330 4679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNA1-201ENST00000382545 7997 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms