Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF17Q9BXT8 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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