Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms