Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms