Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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COPS8Q99627 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
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COPS8Q99627 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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COPS8Q99627 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS8Q99627 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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COPS8Q99627 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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COPS8Q99627 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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COPS8Q99627 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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COPS8Q99627 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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COPS8Q99627 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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COPS8Q99627 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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COPS8Q99627 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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COPS8Q99627 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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