Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TCF12Q99081 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TCF12Q99081 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TCF12Q99081 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCF12Q99081 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCF12Q99081 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCF12Q99081 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCF12Q99081 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TCF12Q99081 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCF12Q99081 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCF12Q99081 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TCF12Q99081 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCF12Q99081 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCF12Q99081 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCF12Q99081 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TCF12Q99081 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TCF12Q99081 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCF12Q99081 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TCF12Q99081 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TCF12Q99081 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCF12Q99081 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TCF12Q99081 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TCF12Q99081 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TCF12Q99081 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TCF12Q99081 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCF12Q99081 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCF12Q99081 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCF12Q99081 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCF12Q99081 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCF12Q99081 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCF12Q99081 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TCF12Q99081 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TCF12Q99081 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCF12Q99081 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCF12Q99081 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCF12Q99081 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCF12Q99081 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TCF12Q99081 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCF12Q99081 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TCF12Q99081 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCF12Q99081 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCF12Q99081 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCF12Q99081 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCF12Q99081 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCF12Q99081 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCF12Q99081 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TCF12Q99081 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TCF12Q99081 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCF12Q99081 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TCF12Q99081 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCF12Q99081 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCF12Q99081 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TCF12Q99081 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCF12Q99081 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCF12Q99081 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TCF12Q99081 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TCF12Q99081 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCF12Q99081 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TCF12Q99081 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCF12Q99081 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TCF12Q99081 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCF12Q99081 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TCF12Q99081 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TCF12Q99081 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TCF12Q99081 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCF12Q99081 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TCF12Q99081 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TCF12Q99081 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCF12Q99081 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TCF12Q99081 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCF12Q99081 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCF12Q99081 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCF12Q99081 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCF12Q99081 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCF12Q99081 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCF12Q99081 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCF12Q99081 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCF12Q99081 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TCF12Q99081 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCF12Q99081 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TCF12Q99081 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TCF12Q99081 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCF12Q99081 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TCF12Q99081 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCF12Q99081 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCF12Q99081 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCF12Q99081 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TCF12Q99081 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TCF12Q99081 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCF12Q99081 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TCF12Q99081 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TCF12Q99081 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TCF12Q99081 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TCF12Q99081 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TCF12Q99081 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TCF12Q99081 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TCF12Q99081 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TCF12Q99081 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TCF12Q99081 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TCF12Q99081 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms