Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC114Q96M63 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms