Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms