Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX27Q96L92 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX27Q96L92 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX27Q96L92 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX27Q96L92 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX27Q96L92 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX27Q96L92 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX27Q96L92 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX27Q96L92 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX27Q96L92 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX27Q96L92 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX27Q96L92 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX27Q96L92 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX27Q96L92 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX27Q96L92 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX27Q96L92 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX27Q96L92 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX27Q96L92 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX27Q96L92 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX27Q96L92 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX27Q96L92 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX27Q96L92 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX27Q96L92 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX27Q96L92 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX27Q96L92 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX27Q96L92 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX27Q96L92 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX27Q96L92 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX27Q96L92 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX27Q96L92 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX27Q96L92 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX27Q96L92 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX27Q96L92 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX27Q96L92 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX27Q96L92 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX27Q96L92 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX27Q96L92 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX27Q96L92 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX27Q96L92 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX27Q96L92 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX27Q96L92 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX27Q96L92 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX27Q96L92 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX27Q96L92 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX27Q96L92 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX27Q96L92 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX27Q96L92 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX27Q96L92 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX27Q96L92 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX27Q96L92 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX27Q96L92 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX27Q96L92 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX27Q96L92 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX27Q96L92 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX27Q96L92 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX27Q96L92 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX27Q96L92 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX27Q96L92 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX27Q96L92 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX27Q96L92 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX27Q96L92 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX27Q96L92 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX27Q96L92 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX27Q96L92 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX27Q96L92 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX27Q96L92 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms