Protein–RNA interactions for Protein: Q96GX2

ATXN7L3B, Ataxin-7-like protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN7L3BQ96GX2 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms