Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RTP4Q96DX8 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms