Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EDAQ92838 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EDAQ92838 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EDAQ92838 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EDAQ92838 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EDAQ92838 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EDAQ92838 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EDAQ92838 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EDAQ92838 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EDAQ92838 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EDAQ92838 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EDAQ92838 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EDAQ92838 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EDAQ92838 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
EDAQ92838 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
EDAQ92838 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
EDAQ92838 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EDAQ92838 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EDAQ92838 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EDAQ92838 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EDAQ92838 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EDAQ92838 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EDAQ92838 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EDAQ92838 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EDAQ92838 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EDAQ92838 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
EDAQ92838 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EDAQ92838 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EDAQ92838 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EDAQ92838 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EDAQ92838 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EDAQ92838 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EDAQ92838 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EDAQ92838 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EDAQ92838 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EDAQ92838 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EDAQ92838 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EDAQ92838 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EDAQ92838 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EDAQ92838 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EDAQ92838 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EDAQ92838 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EDAQ92838 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EDAQ92838 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EDAQ92838 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EDAQ92838 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EDAQ92838 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EDAQ92838 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EDAQ92838 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EDAQ92838 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
EDAQ92838 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EDAQ92838 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EDAQ92838 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EDAQ92838 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EDAQ92838 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EDAQ92838 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EDAQ92838 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EDAQ92838 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EDAQ92838 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
EDAQ92838 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EDAQ92838 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EDAQ92838 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EDAQ92838 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EDAQ92838 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EDAQ92838 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EDAQ92838 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EDAQ92838 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EDAQ92838 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EDAQ92838 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EDAQ92838 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EDAQ92838 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EDAQ92838 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EDAQ92838 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EDAQ92838 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EDAQ92838 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EDAQ92838 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EDAQ92838 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EDAQ92838 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EDAQ92838 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EDAQ92838 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EDAQ92838 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EDAQ92838 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EDAQ92838 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EDAQ92838 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EDAQ92838 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EDAQ92838 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EDAQ92838 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EDAQ92838 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EDAQ92838 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EDAQ92838 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EDAQ92838 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EDAQ92838 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EDAQ92838 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EDAQ92838 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EDAQ92838 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EDAQ92838 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EDAQ92838 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EDAQ92838 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EDAQ92838 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EDAQ92838 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms