Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.2 ms