Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI1

RHOT2, Mitochondrial Rho GTPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT2Q8IXI1 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOT2Q8IXI1 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RHOT2Q8IXI1 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RHOT2Q8IXI1 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RHOT2Q8IXI1 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RHOT2Q8IXI1 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RHOT2Q8IXI1 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RHOT2Q8IXI1 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RHOT2Q8IXI1 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RHOT2Q8IXI1 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOT2Q8IXI1 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOT2Q8IXI1 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOT2Q8IXI1 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOT2Q8IXI1 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOT2Q8IXI1 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOT2Q8IXI1 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOT2Q8IXI1 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOT2Q8IXI1 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOT2Q8IXI1 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOT2Q8IXI1 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOT2Q8IXI1 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOT2Q8IXI1 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOT2Q8IXI1 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOT2Q8IXI1 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOT2Q8IXI1 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOT2Q8IXI1 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOT2Q8IXI1 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOT2Q8IXI1 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOT2Q8IXI1 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOT2Q8IXI1 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOT2Q8IXI1 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOT2Q8IXI1 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOT2Q8IXI1 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOT2Q8IXI1 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOT2Q8IXI1 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOT2Q8IXI1 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOT2Q8IXI1 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOT2Q8IXI1 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOT2Q8IXI1 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOT2Q8IXI1 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOT2Q8IXI1 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOT2Q8IXI1 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOT2Q8IXI1 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOT2Q8IXI1 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOT2Q8IXI1 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOT2Q8IXI1 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOT2Q8IXI1 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOT2Q8IXI1 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOT2Q8IXI1 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOT2Q8IXI1 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOT2Q8IXI1 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOT2Q8IXI1 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOT2Q8IXI1 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOT2Q8IXI1 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms