Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 C3orf20-202ENST00000412910 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 TJAP1-205ENST00000372452 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCBE1Q6UXH8 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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