Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXD1

HRCT1, Histidine-rich carboxyl terminus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCT1Q6UXD1 RIMS1-201ENST00000264839 7055 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 BRWD1-204ENST00000380800 7605 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 NUMA1-205ENST00000393695 7343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 AC022384.1-202ENST00000450534 2831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 PHF21B-202ENST00000396103 3540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 ACVR2A-201ENST00000241416 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 KCNMA1-232ENST00000638306 3811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 UGT3A1-201ENST00000274278 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 TJAP1-201ENST00000259751 2720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 IYD-208ENST00000500320 2158 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 LRRC41-206ENST00000615587 2842 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 NPR3-201ENST00000265074 7344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 ANKRD17-202ENST00000358602 10784 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 IFFO1-206ENST00000465801 2850 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 MRVI1-216ENST00000547195 6155 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 SMG9-201ENST00000270066 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms