Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC174Q6PII3 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms