Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
LETMD1Q6P1Q0 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LETMD1Q6P1Q0 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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