Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms