Protein–RNA interactions for Protein: Q68D86

CCDC102B, Coiled-coil domain-containing protein 102B, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102BQ68D86 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC102BQ68D86 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms