Protein–RNA interactions for Protein: Q5FBB7

SGO1, Shugoshin 1, humanhuman

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO1Q5FBB7 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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SGO1Q5FBB7 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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SGO1Q5FBB7 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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SGO1Q5FBB7 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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SGO1Q5FBB7 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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SGO1Q5FBB7 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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SGO1Q5FBB7 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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SGO1Q5FBB7 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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SGO1Q5FBB7 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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SGO1Q5FBB7 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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