Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAL6

VWC2, Brorin, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWC2Q2TAL6 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
VWC2Q2TAL6 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms