Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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ECM1Q16610 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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ECM1Q16610 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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ECM1Q16610 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
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ECM1Q16610 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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