Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DDB1Q16531 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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