Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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