Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TCEA2Q15560 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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TCEA2Q15560 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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TCEA2Q15560 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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TCEA2Q15560 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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