Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SHPRHQ149N8 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
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