Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 HCG24-202ENST00000414398 717 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
COL19A1Q14993 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms