Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SSPNQ14714 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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