Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.3 ms