Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
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SCGB2A2Q13296 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SCGB2A2Q13296 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SCGB2A2Q13296 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SCGB2A2Q13296 KIAA0513-201ENST00000258180 7404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SCGB2A2Q13296 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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