Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 DNAJC14-202ENST00000317287 2774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 GAS8-220ENST00000620723 3308 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 FAM102A-202ENST00000373084 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 FAM76A-204ENST00000373954 3567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 ARHGAP45-210ENST00000590214 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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CBX3Q13185 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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CBX3Q13185 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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CBX3Q13185 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 ANKRD49-210ENST00000544612 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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CBX3Q13185 SESN2-201ENST00000253063 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 PNMA5-204ENST00000452693 3113 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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CBX3Q13185 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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CBX3Q13185 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 FAM214B-208ENST00000605244 3016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 PLSCR4-203ENST00000433593 2839 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 PDE4A-204ENST00000440014 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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