Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
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FOXF1Q12946 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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FOXF1Q12946 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
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FOXF1Q12946 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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FOXF1Q12946 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
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FOXF1Q12946 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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FOXF1Q12946 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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FOXF1Q12946 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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FOXF1Q12946 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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FOXF1Q12946 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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FOXF1Q12946 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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FOXF1Q12946 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXF1Q12946 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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