Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRJQ12913 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 354.2 ms